Эффективность ДНК-скрининга

По данным многочисленных исследований метод неинвазивного пренатального ДНКскрининга анеуплоидий плода по крови матери обладает высокими диагностическими характеристиками, которые, однако, могут различаться в зависимости от исследуемых хромосом (табл. 1). Здесь и далее диагностические характеристики приводятся с 95% доверительным интервалом в соответствии с «Правилами оценки клинической информативности лабораторных тестов. ГОСТ Р 53022.3-2008».

Таблица 1. Диагностические характеристики ДНК-скрининга анеуплоидий плода по крови матери для различных хромосом (приведены с 95% доверительным интервалом, рассчитанным по обобщенным данным)

Анализируемая
хромосома
Проведено
исследований
Чувствительность, % Специфичность, % Положительная
предиктивная
оценка (PPV)*, %
Отрицательная
предиктивна
оценка (NPV)**, %
21 77 308 99,17 (98,48–99,6) 99,94 (99,91–99,95) 96,07 (94,84–97,08) 99,99 (99,98–99,99)
18 77 308 97,80 (95,7–99,04) 99,94 (99,92–99,96) 88,97 (85,48–91,87) 99,99 (99,98–100)
13 69 572 95,74 (89,46–98,83) 99,93 (99,91–99,95) 64,75 (56,2–72,66) 99,99 (99,99–100)
X/Y 22 237 92,75 (83,89–97,61) 99,91 (99,86–99,94) 76,19 (65,65–84,81) 99,98 (99,95–99,99)

*Положительная предиктивная оценка (PPV) – это процент лиц с положительными результатами теста, у которых имеется искомое заболевание. PPV позволяет оценить вероятность того, что заболевание действительно имеется, если результаты теста положительные. Зависит от свойств теста и характеристик исследуемой выборки;

**Отрицательная предиктивная оценка (NPV) – это процент лиц с отрицательными результатами теста, у которых нет искомого заболевания. NPV позволяет оценить вероятность того, что заболевание действительно отсутствует, если результаты теста отрицательные. Зависит от свойств теста и характеристик исследуемой выборки.

Приведенные данные, а также результаты валидации в российских лабораториях
демонстрируют, что предсказательная ценность отрицательного результата
ДНК-скрининга по крови матери крайне высока и позволяет с высокой вероятностью (>99,9%) исключить наличие анеуплоидий по 21, 18, 13-й и половым хромосомам. В то же время предсказательная ценность положительного результата не достаточно высока и требует обязательного подтверждения с помощью инвазивных методов диагностики. При анализе причин получения ложноположительных результатов ДНК-скрининга было установлено, что у части таких пациентов в дальнейшем были выявлены онкологические заболевания различной локализации в промежутке времени от 3 до 39 недель после проведения исследования. При сопоставлении стадии онкологического заболевания и сроков установления диагноза можно сделать вывод о наличии онкологического процесса на момент проведения исследования по крайней мере в части случаев. Чаще всего у пациентов с онкологическими заболеваниями по результатам неинвазивного ДНК-скрининга выявляли сочетанные хромосомные нарушения, затрагивающие несколько хромосом. В некоторых случаях причиной ошибочных результатов пренатального ДНК-скрининга может явиться мозаицизм, то есть несовпадение генотипа плода с генотипом его оболочек или наличие клеточных линий с разным генотипом в организме матери . Подтверждение и интерпретация случаев мозаицизма является одной из наиболее сложных проблем пренатальной диагностики. Несмотря на отмеченные ограничения, ДНКскрининг значительно превышает по эффективности существующие в настоящее время скрининговые методы, что позволяет рассматривать его в качестве наиболее перспективного.

Возможные проблемы и способы их устранения

Возможные проблемы и способы их устранения представлены в табл.2

Таблица 2. Возможные проблемы и способы их устранения

Описание проблемы Способы устранения
Низкая доля плодовой ДНК (ниже порога аналитической чувствительности метода, обычно 4-5%).  - При сроке беременности менее 11 недель произвести повторное взятие биологического материала не ранее, чем через две недели, но не позднее 17 недель беременности.
- При сроке беременности 11 недель и более при индексе массы тела женщины менее 30 кг/м2 проинформировать врача-генетика о возможном риске наличия анеуплоидий (согласно опубликованным данным низкая доля плодовой ДНК может быть ассоциирована с наличием анеуплоидий). 
Признаки гемолиза в плазме. Повторное взятие крови с использованием иглы большего диаметра и другие меры для предотвращения механического разрушения клеток, а также строгое соблюдение правил транспортировки и хранения биоматериала
Гиперлипемия (хилезная плазма). - При наличии видимых признаков гиперлипемии образец не должен исследоваться, так как нельзя исключить неравномерное распределение внеклеточной ДНК между инфранатантом и жировой фракцией.
- Необходимо произвести повторное взятие биологического материала.
Попадание в исследуемый образец лекарственных препаратов, влияющих на возможность или эффективность выделения нуклеиновых кислот из биологического образца и/или прохождение реакции амплификации (гепарин и др.). Необходимо произвести повторное взятие биологического материала, приняв меры для исключения попадания в исследуемый образец лекарственных препаратов, влияющих на возможность или эффективность выделения нуклеиновых кислот из биологического образца и/или прохождение реакции амплификации.

Безопасность технологии

Степень риска развития нежелательных побочных реакций и побочных эффектов при применении данной технологии определяется риском осложнений
при получении биоматериала (венепункции):

  • образование подкожной гематомы при сквозном прокалывании обеих стенок вены;
  • развитие флебита и тромбофлебита в результате нарушений правил асептики;
  • попадание возбудителя инфекции в сосудистое русло;
  • повреждения надкостницы (периостит), нервов (паралич, неврит), воздушная эмболия вследствие нарушения техники выполнения венепункции.

Профилактика этих осложнений – атравматичное выполнение венепункции с соблюдением правил асептики.

Данный риск считается приемлемым при проведении диагностических мероприятий